Juni Sakurada, sebuah sekolah menengah menutup-in menolak untuk pergi ke sekolah setelah trauma oleh insiden memalukan di sekolah. Suatu hari, ia menerima surat yang meminta “ya atau tidak“, dan memilih “ya“, memenuhi hidup boneka Shinku dan peristiwa asli Rozen Maiden seri berlangsung. Namun, apa yang akan terjadi jika ia telah memilih “tidak”? Meskipun ia mengalahkan menutup-in nya alam, ini Juni tidak dapat menemukan tempat di mana ia berada. Lalu, tiba-tiba muncul Shinku di dunia ini di mana “Maidens Rozen“ tidak seharusnya ada, apa yang akan pertemuan baru mereka membawa?!